中國科學院福建物質結構研究所在2010年以來，福建物構所共承擔973、863科技計劃、國家科技支撐計劃、國家基金創新群體、國家杰出青年基金項目、中科院重大/重要方向項目、福建省科技重大專項等國家、省部級各類重要科研計劃項目約上百項。共有二十多項成果獲得國家和省、部級獎勵，熱點論文科學鑒賞力指數在化學領域居全國的第3位。1998－2007年SCI累計被引用論文篇次位居全國科研機構第10位，SCI收錄論文數連續五年、SCI被引用論文篇數連續四年名列全國科研機構前十位。